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数据挖掘生物信息学:学习高通量测序技术的最新进展!

作者:喜欢学习的WCJ发布时间:2023-08-04

人工智能生物学分析算法是处理生物网络数据的有效方法,它构建机器或程序来模拟人类智能,从而在生物网络中实现分类、聚类和预测任务。在过去的几十年里,我们看到了人工智能生物学分析算法的快速发展。机器学习在生物信息学中的应用非常广泛,它可以具体应用到以下这些情况:


1.基因序列分析:机器学习可以帮助研究人员理解基因序列中的模式。例如,支持向量机(SVM)和人工神经网络(ANN)可以用于基因分类和基因表达数据分析。另外,深度学习方法,如卷积神经网络(CNN)也被用于识别基因序列中的特定模式。


2.蛋白质结构预测:机器学习可以用于预测蛋白质的三维结构。最近,DeepMind的AlphaFold算法利用深度学习技术在蛋白质结构预测中取得了突破性的进展。


3.表观遗传学:机器学习也被用于理解和预测表观遗传标记。例如,随机森林和梯度增强机都被用于预测 DNA 甲基化。


4.药物发现:在药物发现中,机器学习可以帮助预测药物的效果,降低药物研发的成本和时间。例如,深度学习可以用于预测化合物的毒性,药效和药物靶点。



如果您在从事生物医学方面的研究 并且有发顶刊的想法


下面这篇内容会给你思路和方法


九大专题内容


专题一:CRISPR-Cas9基因编辑专题线上培训


专题二:蛋白质晶体结构解析实践应用专题线上培训


专题三:深度学习在基因组学实践应用专题线上培训


专题四:机器学习微生物组学应用专题线上培训


专题五:机器学习代谢组学专题线上培训


专题六:机器学习转录组与表观组学应用专题线上培训


专题七:深度学习单细胞实践应用专题线上培训


专题八:CADD药物设计应用专题线上培训


专题九:AIDD人工智能药物发现专题线上培训




学习目标


【CRISPR-Cas9基因编辑技术】专题课程从全局出发,由浅入深,课程通过基础入门+应用案例实操演练的方式,从最初的原理讲解到最后的应用实战,学完本课程你将掌握基因编辑技术的相关原理及其应用,此外可以学到基因编辑系统的优化策略,可以学到如何操作常用的生物学软件。能够快速运用到自己的科研项目和课题上。


【蛋白质晶体结构解析】蛋白质晶体结构解析课程让学员了解蛋白质晶体结构解析的原理、方法与技术,学习分子克隆、蛋白表达纯化、蛋白结晶方法、软件安装,蛋白结构数据处理,得到高分辨率的蛋白晶体结构。使学员通过本次课程的学习,很轻松地解析出蛋白晶体结构,并进行晶体结构的精修。


【深度学习基因组学】课程通过基础入门+应用案例实操演练的方式,从初学及应用研究的角度出发,带大家实战演练多种深度学习模型在基因组学分析中的各种应用,深入剖析多篇高分文章代码演示及文章复现,通过对这些深度学习在基因组学中的应用案例进行深度讲解和实操,让学员能够掌握深度学习分析高维基因组学、转录组学、蛋白组学等多组学数据流程,系统学习深度学习及基因组学理论知识及熟悉软件代码实操,熟练掌握这些前沿的分析工具的使用以及研究创新深度学习算法解决生物学及临床疾病问题与需求。


【机器学习代谢组学】熟悉代谢组学和机器学习相关硬件和软件;熟悉代谢组学从样本处理到数据分析的全流程;能复现至少1篇CNS或子刊级别的代谢组学文章图片。


【机器学习转录组学与表观组学】本课程学员将学习如何处理和分析转录组和表观组数据,并深入了解这两个领域的关键概念和最新发展。课程内容包括Linux操作系统的基础知识和常用命令行技巧,R编程语言的应用,转录组数据的预处理和差异表达分析,表观组数据的分析方法,以及综合应用和实际项目实践。此外,课程还注重培养学员独立进行转录组和表观组学研究的能力,为他们在这一领域的进一步发展和应用打下坚实的基础。


【深度学习单细胞分析】通过高分文献和代码实操,解析课单细胞深度的课题套路,助力完成学员自己的高分文章!


【机器学习微生物】通过本次培训多个案例的系统讲解让参会学员学会机器学习在微生物组数据分析流程,能够快速运用到自己的科研项目和课题上。


【CADD药物设计与AIDD药物设计】CADD计算机辅助药物设计设计流程,让学员能够掌握包括PDB数据库、靶点蛋白、蛋白质-配体、蛋白-配体小分子、蛋白-配体结构、notepad的介绍和使用、分子对接、蛋白-配体对接、虚拟筛选、蛋白-蛋白对接、蛋白-多糖分子对接、蛋白-水合对接、Linux安装、gromacs分子动力学全程实操、溶剂化分子动力学模拟


【AIDD人工智能药物发现与设计】课程让学员了解药物发现的前沿背景,学习人工智能领域的各类常见算法,熟悉工具包的安装与使用,掌握一定的算法编程能力,能够运用计算机方法研究药物相关问题。通过大量的案例讲解和实践操作,具备一定的AIDD模型构建和数据分析能力。


最后,对以上专题内容感兴趣的老师,可访问(https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg3Mzg5OTI5Mw==&mid=2247485948&idx=1&sn=0ce970b6a974e31b3f3109c9b5cb3289&chksm=ced9bd8ef9ae34981b3bff6569a862b7ebcad9eb9ef9854ad30d9a02b5a5fbbc2f57a920d7d8#rd)了解或者添加V.X交流学习:LIv51666 



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