expowo：用于挖掘全球植物多样性和分布数据的R包

Zuanny DC, et al. (2024). expowo: An R package for mining global plant diversity and distribution data. Applications in Plant Sciences, doi: 10.1002/aps3.11609.

（2024年7月30日发表）

摘要参考翻译：从自然史藏品和分类数据库中获取的植物分布和多样性数据越来越多地在网上公布，例如英国皇家植物园邱园的世界植物在线（POWO）数据库。生物多样性信息的不断积累需要生物信息学工具的进步，以便访问和处理海量数据，用于下游科学研究。我们在此介绍一个开源软件包expowo，它有助于从POWO中提取和使用植物学数据。expowo软件包使用R语言实现，旨在处理整个维管植物生命树。它包含的功能可轻松提取出维管植物所有科、属、种的分类和分布信息。它可输出任何植物科中每个属的完整物种列表，包括相关的原始出版物、同物异名、分布情况，并绘制国家和植物国家（botanical country）水平的物种丰富度全球地图，以及显示物种发现积累曲线和命名法随时间变化的图表。为了展示expowo在生成易于处理的输出结果方面的优势，我们还展示了一组生物多样性国家和具有代表性的物种丰富、生态重要的被子植物科的经验实例。通过利用生物信息学工具来适应不同水平的R编程能力，expowo的功能可以帮助R编程专业知识有限的用户从在线资源中有效地提炼出特定的植物学信息，并制作地图和图形来进一步解释生物地理学和分类学模式。