大家好,欢迎观看《时空日报》第328期。本期介绍的时空/细胞组学相关研究文章共计2篇。以下是应用时空云平台STOmics Cloud的Genpilot模块生成的文章概要,并辅以人工审核,供了解参考。
1、牙髓中的三级淋巴样结构在抗击细菌感染中的作用
Tertiary Lymphoid Structure in Dental Pulp: The Role in Combating Bacterial Infections
Advanced Science; IF: 14.300; DOI: 10.1002/advs.202406684
内容概要:
① 在医学研究领域,三级淋巴样结构(TLS)与多种疾病状态密切相关,其中包括癌症和慢性感染。TLS的形成受到多种因素的调节,这些因素因所在器官的不同而有所差异。然而,尽管TLS在免疫反应中发挥着重要作用,但关于其形成的具体分子机制,目前仍然缺乏明确的认识。
② 牙髓作为牙齿内部的软组织,其结构特殊,由刚性矿化组织所包围,并通过根尖孔与外界相连。牙髓内含有少量的免疫细胞,这使得它在面对细菌感染时,能够产生定向的免疫反应。鉴于牙髓的这种特性,它成为了研究TLS的理想模型。通过对健康和发炎的人类牙髓进行深入研究,科学家们发现了TLS的已知标志物,这些标志物在发炎的牙髓中均有表达,包括C-C趋化因子配体19(CCL19)、溶酶体相关膜糖蛋白3(LAMP3)、CC趋化因子受体7(CCR7)和CD86等。与健康牙髓相比,发炎牙髓中的免疫细胞种类和比例均有所增加,细胞间的通讯也更加频繁。
③ 为了进一步验证TLS在牙髓炎中的作用,科学家们还进行了多重免疫荧光染色实验,并在患有牙髓炎的牙髓中观察到了典型的TLS结构。这一发现与CC趋化因子配体3(CCL3)的高表达相一致,提示CCL3可能是TLS形成的关键驱动因素。此外,在牙髓炎的小鼠模型中,科学家们也观察到了TLS的存在。这些研究结果共同为理解TLS在感染应答中的形成和功能提供了新的见解。
其他研究:龋齿,趋化因子,牙髓,免疫细胞,牙髓炎,第三淋巴结构(TLS), scRNA-seq ; Li R, Gu F, Peng L, et al.; State Key Laboratory of Oral & Maxillofacial Reconstruction and Regeneration, Key Laboratory of Oral Biomedicine Ministry of Education, Hubei Key Laboratory of Stomatology, School & Hospital of Stomatology, Wuhan University, Wuhan, 430079, China.
2、早期治疗HIV-1感染中,病毒储存库细胞演化过程中的先天性免疫活动痕迹
Footprints of innate immune activity during HIV-1 reservoir cell evolution in early-treated infection
Journal of Experimental Medicine; IF: 12.600; DOI: 10.1084/jem.20241091
内容概要:
① 在HIV-1感染的治疗策略中,一个引人注目的现象是,如果在感染早期就启动抗逆转录病毒治疗(ART),那么患者在后续的治疗中断期间,更有可能维持无药状态下的病毒控制。然而,这一现象背后的具体原因,目前科学家们尚未完全理解。为了更深入地探究这一机制,研究人员利用了一项评估治疗性HIV-1疫苗的人类随机对照临床试验的样本。
② 通过对这些样本的分析,研究人员发现,早期启动ART的患者,在治疗开始后的第一年内,会经历一个加速且有效的选择过程,使得位于抑制性染色质位置的基因组完整的HIV-1前病毒被筛选出来。值得注意的是,这一过程并不受疫苗诱导的HIV-1特异性T细胞反应的影响,表明存在其他机制在起作用。
③ 为了揭示这些机制,研究人员进一步进行了单细胞蛋白质基因组学分析。他们发现,携带完整HIV-1的细胞具有独特的表型特征,这些特征表明它们经历了由先天性免疫反应介导的免疫选择。具体来说,这些细胞中的HLA-C、HLA-G、IL-10受体和其他参与先天性免疫调节的标志物,都出现了轻微但显著的上调。这些发现共同表明,在HIV-1感染的早期治疗中,病毒储存库细胞经历了加速的免疫选择,这一过程至少部分由先天性免疫反应所驱动。
疾病研究:HIV-1感染,早期ART, 病毒控制,前病毒选择,先天性免疫反应,单细胞蛋白质基因组学; Sun W, Gao C, Gladkov GT, et al.; Ragon Institute of MGH, MIT and Harvard , Cambridge, MA, USA.