CCF开源创新大赛暨第二届Bio-OS开源开放大赛总决赛广州圆满落幕
11 月 11 日，由中国计算机学会（CCF，China Computer Federation）和广州实验室指导，火山引擎和 Intel 联合主办的 CCF 开源创新大赛暨第二届 Bio-OS 开源开放大赛（以下简称“大赛”）总决赛在广州成功举办。
本次大赛是一项生物信息领域的全国性公益大赛，协办单位包括中国计算机学会开源发展委员会、中国生物信息学学会（筹）、上海生物信息学会、广东省生物信息学会，公益支持单位为中国光华科技基金。
本次大赛以“开源共赢，科学无限”为宗旨，旨在通过大赛牵引和开源开放的 Bio-OS 平台支撑，推动国内生物信息领域的交流与合作，共建“开放、创新、合作、共赢”的新生态。
汇聚生信领域的创新力量
本次大赛分为论文复现赛、任务挑战赛、AI 算法三个赛道，于 5 月 20 日正式启动，共设置 31.5 万元奖金池。自大赛启动以来，得到了 63 所高校师生和 28 家生信企业的积极响应。
经过近 6 个月的激烈角逐与层层选拔，来自生物信息领域的高校师生、科研工作者和相关企业、组织等组成的 297 支队伍中，最终 22 支队伍脱颖而出，成功晋级总决赛，包括来自斯坦福大学、清华大学、北京大学、浙江大学、上海交通大学、躬富科技、广州穗和生物技术有限公司、联川生物、杭州图灵智能等知名高校和企业。
在 11 月 11 日的大赛总决赛上，这 22 支队伍进行了现场展示并接受了业内专家的专业评审。经过评审团的最终评审，最终确定了本届大赛一等奖、二等奖、三等奖。
11 月 12 日，获胜团队在火山引擎第二届 AI for Science 闭门研讨会暨第二届 Bio-OS 开源开放大赛颁奖典礼上接受表彰。
CCF 开源创新大赛暨第二届 Bio-OS 开源开放大赛各赛道获奖名单如下：
- 论文复现赛道：
一等奖：乐想事成（成都东软学院）
二等奖：碱基跳动（北京大学）、不难的不会复现（斯坦福大学/北京科技大学）
三等奖：Sulab - Soaring Eagle（温州医科大学）、且行之队（联川生物/杭州师范大学）、生物信息智析队（天津医科大学）
（来源：火山引擎）
- 任务挑战赛道：
一等奖：绿瓦生信（上海交通大学）
二等奖：崭晴生物（浙江崭晴生物科技有限公司）、BPG（广东省人民医院/华南理工大学/香港中文大学（深圳））
三等奖：催化剂加-BioMed agent OS 先行者（浙江大学）、YuLabSMU（南方医科大学）
（来源：火山引擎）
- AI 算法赛道：
一等奖：抗体三次方（北京协和医学院/杭州电子科技大学/南京农业大学）
二等奖：better++（华侨大学）、从容应队（西安交通大学）
三等奖：医研定真（广东工业大学）、名扬工作室（广州实验室/天津大学）、智汇数（山东大学）、 IntelliX（广州实验室/广州医科大学）
（来源：火山引擎）
Bio-OS 平台：加速完成大数据的挖掘分析任务
长期以来，生物信息学研究者面临如何处理和解读庞大且复杂的生物学数据集的问题。这些数据不仅包括基因组序列、蛋白质结构，还涵盖了各种生物标志物和临床信息，其规模之大、复杂度之高，对传统分析方法提出了严峻挑战。
在此背景下，广州实验室与火山引擎合作，共同开发了生物医学大数据操作系统（Bio-OS，Bio-medical big data operating system）。
平台采用云原生架构，提供全面的服务，涵盖生物医学数据的传输、存储、管理以及生物信息分析等关键环节。并且，Bio-OS 贯穿生物医学研究的整个流程，从数据的初步处理、核心分析到最终的后处理阶段。
以 Workspace 为操作核心，Bio-OS 采用开放兼容的技术架构，致力于提升生物信息分析的可重复性、结果的可复现性、操作的可追溯性，并促进知识的积累与传播。
此外，Bio-OS 遵循全球基因组学与健康联盟的开放标准和规范，不断整合和沉淀标准化的数据集与工具资源，使用户能够便捷地获取并快速执行各种规模的基因组分析任务。
为扩大 Bio-OS 开源开放大赛的影响并增强学生的实践技能，大赛主办方还在高校举办了系列创新活动，包括大赛宣讲会、行业专家赛题解析和 Bio-OS 操作实践，以深化学生对大赛的理解并提升操作能力。
同时，大赛与高校合作建立 Bio-OS 实验室和俱乐部，他们还开发了 Bio-OS 相关课程，整合线上线下教学资源，建立学生社区以促进技术交流和学习成果转化，旨在培养学生的创新和实践技能，推动生物信息学领域的发展，为 Bio-OS 技术的研发和应用构建了良好的产业生态。
据了解，首届 Bio-OS 开源开发大赛于 2023 年成功举办。截至目前，参赛团队已贡献 30+成熟生信分析流程，700G+生信数据，可转化的生信高质量论文 15 篇。生信开发者为 Bio-OS 贡献三级分析可视化工具 21 个，可被全部收录并作为功能提供至商业版中。
随着本次大赛总决赛的圆满结束，期待下一届大赛能够继续推动生物信息领域的创新和发展，为 AI for Science 研究带新进展，并创造更多的可能性。
关于火山引擎：
火山引擎（https://www.volcengine.com/）是字节跳动旗下的云服务平台，将字节跳动快速发展过程中积累的增长方法、技术能力和应用工具开放给外部企业，帮助企业构建体验创新、数据驱动和敏捷迭代等数字化能力，实现业务可持续增长。