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孟德尔随机化实操代码1

作者:Eric师兄发布时间:2024-09-09

此代码对应视频课程BV1MmpMeWEzW,希望会对大家有所帮助。

 0.准备工作

首先要安装必要的R包

注意:如果安装GitHub上的R包被限流,可以使用本地安装的方法来安装,也可以修改本地api突破流量限制,如果两种方法都不会,也可以等待12小时后再安装。

加载安装好的R包

清空内存与工作环境,并且设置工作路径

在这里以BMI作为暴露,以慢性肾脏疾病(CKD)作为结局,用代码来展示如何进行MR分析。下面为ieu数据库中,暴露和结局的GWASid。

在ieu数据库中,有两种读取数据的方法,分别是在线读取数据和本地读取数据。

1.在线读取暴露与结局的数据

2.本地读取暴露与结局数据

希望大家可以一键三连~


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