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深度解读外泌体:形成构成、分离及鉴定、功能和应用

作者:科研根号三发布时间:2024-10-16

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一、外泌体的形成及构成

1)什么是外泌体?

外泌体(Exosome)是细胞外囊泡(Extracellular  Vesicles, EV) 的一种 ,是 由脂质双分子层包裹的微小囊泡 ,直径一般为 40-100nm。外泌体的膜主要由脂质和 蛋白质组成,其内容物中除蛋白质外还发现了多种核酸 ,包括 DNA 、mRNA、microRNA 和 ncRNA 等。

外泌体可以由所有细胞类型分泌,包括免疫细胞、神经元细胞、上皮细胞 、内皮细 胞 、胚胎细胞 、癌细胞和间充质干细胞等,广泛分布于血液、尿液唾液、乳汁 、胆汁等各种体液中。

注1:不同文章中对外泌体直径的定义有所不同 ,30-200nm是个较大区间,40-100nm是一个常用范围。

2)外泌体的形成

外 泌 体 源 自 于 细 胞 质 膜 的 内 吞 作 用 。 细 胞质膜内陷形成早期内体(Early Endosome),而早期内体质膜内陷出芽形成多泡体 ,多泡体外膜与细胞膜融合后 ,向细胞外释放出外泌体。

在外泌体形成过程中 ,供体细胞的胞质内容物会被装载到外泌体中 ,一起被供体 细胞通过胞吐作用分泌到细胞外 ,进而通过受体-配体相互作用的方式传递给受体细胞。

 

图1 外泌体的形成、内容物 源自[1]

3)外泌体蛋白类型

由于外泌体的独特形成方式 ,其尺寸 、内容物 、功能和来源均具有异质性。不同 类型细胞分泌的外泌体组分有所不同,甚至相同类型细胞分泌的外泌体也可能存在差异。但是在蛋白类型上 ,外泌体还是有一些规律可循。

外泌体蛋白一般包括:整体外泌体膜蛋白 、内外周膜蛋白 、脂质锚定外膜蛋白 、 脂质锚定内膜蛋白、外围表面蛋白和外泌体酶。其中一些广泛分布和细胞特异性的蛋 白会被定位到外泌体中,包括细胞骨架蛋白、代谢酶、信号转导分子、热激蛋白(HSP70和 HSP90) 、四次跨膜蛋白(CD9、CD63 、CD81 和 CD82)。

值得注意的是 ,这些已发现的外泌体蛋白中绝大部分也存在于其他类型细胞外囊 泡中,包括一些所谓的“外泌体 Marker ”(如热激蛋白 、flotillins、MHC 分子) ; 而同时确有一些外泌体 Marker 被认为是相对特异的,包括 CD9、CD63、CD81、TSG101、Alix、HSP70 和 HSP90。因此单独外泌体蛋白 ,是外泌体鉴定的必要不充分条件。

图 2 外泌体蛋白类型 源自[2]


二、外泌体的分离及鉴定


1)外泌体的分离与富集

外泌体的分离和富集主要通过差速超速离心 、密度梯度超速离心 、过滤 、超滤 、 超滤与超速离心结合 、试剂盒提取等传统方法 ;此外,微珠 、微流控芯片和热泳技术等新技术的应用也使得外泌体能够更加快速 、方便地富集。


图 3 外泌体分离纯化流程 源自[3]

A. 超速离心   B.密度梯度离心


 2)外泌体的鉴定

那么分离富集之后,我们又该如何鉴定提取出来的物质是外泌体呢?

上面我们提到外泌体蛋白是外泌体鉴定的必要不充分条件 ,这是其一 ,一般使用 蛋白质印迹技术(Western blot)鉴定;另外我们还需要至少两种外泌体单个特征的 鉴定方法:形态表征的鉴定如透射电子显微镜(TEM) 、扫描电子显微镜(SEM) 、冷 冻电子显微镜(cry o EM) 、原子力显微镜(AFM)等;以及粒径分布表征的鉴定如动态光散射(DLS)技术 、纳米颗粒跟踪分析(NTA) 、可调电阻脉冲传感(TRPS)等。

 

1)  外泌体蛋白分析

关于细胞外囊泡蛋白层面的表征 ,国际细胞外囊泡研究协会(ISEV)建议至少检 测三类蛋白(两阳一阴)以证明其特征:(A)跨膜或 GP I 锚定蛋白 ,证明与质膜和/或内体相关,常用的有 CD63、CD9、CD81 等;(B)被囊括进去的胞质蛋白,如 TSG101、HSP70、ALIX 等;(C)存在于其他胞内细胞器的阴性蛋白,如核蛋白 Histone 、 Lamin A,内质网蛋白 calnexin,高尔基体蛋白 GM130,线粒体蛋白 cytochrome c,以及细胞骨架蛋白 cytokeratin 18 等。

注:由于目前的提取技术无法获得完全纯化的外泌体,因此 ISEV 建议将提取到的 小于 200nm 的囊泡统称之为小细胞外囊泡(small extracellular vesicle,sEV),sEV 这一概念也被越来越多的论文采用及被越来越多的杂志接纳。

其中,CD63、CD9、CD81 以及 TSG101、HSP70 、HSP90 、ALIX 等是最常用到的外泌

体标志物。

图 4 外泌体标志物 源自[4,5]


2)外泌体形态和粒径分布分析

 透射电子显微镜(TEM)被认为是识别和表征单个外泌体的常用方法。TEM 视野下,外

泌体呈圆形或杯状结构,大小范围为 40-150nm。

 纳米颗粒跟踪分析(NTA)是一种广泛用于确定外泌体浓度和尺寸分布的方法。外泌体

的粒径分布区间在 40-150nm。

图 5 外泌体形态和粒径分布分析 源自[6]

A.TEM 分析   B. NTA 分析

经过了蛋白维度 、形态维度以及粒径分布维度三个层面的表征 ,我们基本可以确

认分离出的组分为外泌体。

 

三、外泌体的功能和应用

 外泌体能够将核酸 、蛋白质和脂质在内的多种生物活性分子从供体细胞转移到受 体细胞 ,介导细胞间通讯和分子转运 ;并且外泌体可以由所有类型的活细胞分泌 ,在体液中广泛分布。因此外泌体在生理病理标志物和药物递送方面有巨大的应用潜力。

 

1)外泌体作为肿瘤液体活检的新前沿

 癌症是全世界人口死亡的主要原因之一。相比于传统的组织活检 ,液体活检侵入

性极小 、样本易收集 ,逐渐成为癌症诊断和预后预测的新策略。

 注:液体活检包括循环肿瘤细胞(CTCs) 、循环肿瘤 DNA(ctDNA)和外泌体三种

检测。

外泌体携带的内容物不仅能够反映亲本细胞的生理病理特征;它还具有脂质双分 子层的稳定结构,即使在恶劣的肿瘤微环境下也能够稳定循环;而且体液中包含大量外泌体。因此外泌体成为液体活检中最具潜力的新型生物标志物。


图 6 外泌体作为液体活检的新靶点 源自[1]

据已有报道,外泌体蛋白和外泌体 RNA 均可成为癌症早期诊断标志物:

非小细胞肺癌: 非小细胞肺癌占肺癌死亡人数的 80%以上 。非小细胞肺癌患者和 健康者之间血液中外泌体 miRNA-21、miRNA-378 、miRNA-139 和 miRNA-200 存在差异

表达,为非小细胞肝癌的早期诊断提供了更多可选的生物标记物[7]。

肝癌:外泌体 miRNA-21 抑制肝癌细胞的凋亡,并在肝癌患者中上调;CEA 和 GPC-3

等外泌体蛋白能够区分肝癌患者和健康者 ,是无创性癌症诊断的潜在生物标记物。

胃癌: 外泌体 miRNA-15b-3p 在胃癌组织 、细胞系和血清中高表达 ,血清外泌体 miRNA-15b-3p 可作为一种潜在的胃癌诊断和预后生物标志物,可用于胃癌的精准靶向

治疗[8]。

乳腺癌: 乳腺癌是女性癌症相关死亡的最常见原因 。 癌细胞衍生的外泌体

miRNA-21、miRNA-222 和 miRNA-200c 可以在体液中定量,并用于乳腺癌诊断[9]。

 结直肠癌:结直肠癌是造成全球癌症相关死亡的第二大原因。结直肠癌患者血清

中外泌体 C ircRNA-0004771 上调 ,可以区分 I 期和 II 期结直肠癌患者与其他良道疾病,因此可以作为结直肠癌的潜在诊断标记物[10]。此外,miRNA-15b、miRNA-21 和 miRNA-31 在结肠癌患者的血清外泌体中高度表达 ,对结直肠癌的诊断有潜在的应用价值[11]。

胰腺癌:外泌体 miRNA-10b 是胰腺癌进展相关的公认指标之一 ,广泛用于胰腺导 管腺癌的早期诊断。g lyp ican-1(GPC1)特异性地富集于肿瘤细胞来源的外泌体上, 富含 GPC1 的循环外泌体(GPC1+crExos)能绝对特异而敏感地在胰腺癌患者的血清中检测到 ,将早期和晚期胰腺癌患者与良性胰腺疾病患者和正常群体区分出来[12]。

前列腺癌:相比于广泛使用的前列腺癌的生物标记物 PSA,外泌体 ephrinA2 能够 更准确的区分前列腺癌患者和前列腺增生患者[13]。此外,前列腺癌患者的血清外泌体中 EpCAM 和 PSMA 的表达增加[14]。

2)外泌体作为无细胞治疗的新兴方案

外泌体作为一种天然的纳米级别运输囊泡 ,它还具备细胞以及人工合成囊泡(脂 质体等)所不具备的一些优良特性,比如说低免疫原性 、高耐受性 、高通透性 、可靶向改造 、易获得等。因此其在疾病治疗中应用潜能也吸引了人们的关注。

从树突细胞 、成纤维细胞和间充质干细胞分离出来的治疗性外泌体 ,能够对靶细 胞产生特定的作用 ,比如新抗原呈递 、免疫调节和药物有效荷载递送。并且不同的外 泌体可以通过不同的进入方式或者互作机制(受体介导的内吞、网格蛋白包被的小孔、 脂筏 、吞噬作用 、胞饮作用等) 来控制其对特定靶细胞的影响。其中基于表面配体-受体呈递的外泌体使得精准靶向成为可能。

图 7 治疗性外泌体的细胞摄取方式 源自[15]

有研究显示,间充质干细胞来源的小细胞外囊泡(MSC-sEV)能够模拟其亲代细胞, 执行更高安全性和生物相容性的再生能力 ,恢复靶细胞功能[16];并且 ,MSC-sEV 还 可以被改造,通过负载一个核酸(si-RCP)而获得缺氧适应性 ,进而轻松适应生理性

低氧微环境这个天然屏障,抵达椎间盘并发挥功能 ,治疗椎间盘退变疾病[17]。

也有研究显示 ,巨噬细胞衍生的外泌体可以直接负载小分子药物紫杉醇(PTX)发 挥抗肿瘤作用[18];并且 ,该细胞来源的外泌体还能够穿透血脑屏障 ,将一种货物蛋白(BDNF,脑源性神经营养因子)递送至大脑,发挥中枢神经系统疾病治疗功效[19]。

总而言之 ,外泌体作为一个天然的信息和物质传递系统 ,在疾病的诊断和治疗中 具有巨大的潜力和应用前景 ,值得我们投入大量的人力和物力去探索 、研究和改造;

这些研究成果也将给肿瘤等疑难杂症的诊断 、治疗和预后带来巨大的突破和改变。

 


参考文献

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