宝子们,生科人实验互帮互助微信群建好了!WB、流式细胞术、PCR、免疫组化/荧光、Elisa...
细胞的死亡方式有很多种,按照是否能调控分为2种。
意外性细胞死亡(ACD):指的是不能加以调控的死亡方式,由意外的伤害刺激触发,这些伤害刺激超出了细胞的可调节能力,从而导致细胞死亡的发生。
意外性细胞死亡(ACD)包括:细胞坏死(Necrosis)
调节性细胞死亡(Regulated cell death, RCD):是可以加以调控的死亡方式,调控的方式有(诱发、加速、抑制、阻断),如细胞凋亡,细胞自噬,细胞焦亡,细胞焦亡等。
调节性细胞死亡(RCD)包括但不限于:
细胞凋亡(Apoptosis)
自噬(Autophagy)
坏死性凋亡(Necroptosis)
细胞焦亡(Pyroptosis)
铁死亡(Ferroptosis)
铜死亡(cuproptosis)
程序性细胞死亡 (PCD)
溶酶体细胞死亡(LCD)
氧死亡(Oxeiptosis)
炎症性程序细胞死亡(PANoptosis)
内吞细胞死亡(Entotic cell death)
Netotic cell death(网状细胞死亡)
细胞内碱化死亡(Alkaliptosis)
PARP-1依赖性细胞死亡(Parthanatos)
不同的细胞死亡方式有其特异的生化特征,形态特征、核心靶点基因、调控路径等。
本文总结了细胞铁死亡、凋亡、自噬、坏死、焦亡5种死亡方式的特异区别,帮你从多个维度快速认识以及区分不同的细胞死亡方式!
1、生化特征
铁死亡:抑制 xCT,降低 GSH,抑制 GPX4;铁积累和脂质过氧化
凋亡:caspases 寡核小体 DNA 片段的激活
自噬:溶酶体活性增加
坏死:ATP 水平下降;RIP1、RIP3 和 MLK 的激活
焦亡:依赖或非依赖于 caspase-1 活化,GSDMD 切割和促炎细胞因子的释放
2、形态学特征
铁死亡:线粒体变小,线粒体嵴减少或消失,以及线粒体外膜破裂
凋亡:质膜起泡,细胞和核体积减少,核碎裂
自噬:双膜结构自噬溶酶体的形成
坏死:质膜破裂,细胞器肿胀,染色质适度凝结
焦亡:核复缩,细胞肿胀和细胞膜出现孔洞,细胞塌陷破裂
3、核心调控基因
铁死亡:正向:VDAC2/3, Ras, NOX, TFR1, p53, CARS; 负向:GPX4, SLC7A11, HSPB1, NRF2.
凋亡:正向:p53, Bax, Bak, Other pro-apoptotic, Bcl-2 family proteins; 负向:Bcl-2, Bcl-XL, Other anti-apoptotic, Bcl-2 family proteins.
自噬:正向:LC3, ATG5, ATG7, Beclin 1, Other ATG family proteins.
坏死:正向:RIP1, RIP3, MLK L.
焦亡:正向:CASP1, CASP11, GSDMD; 负向:GPX4;ESCRT-III;PKA
4、调节路径
铁死亡:xCT 和Gpx4、MVA、HSF1-HSPB1、p62-Keap1-Nrf2 通路、LSH 信号通路
凋亡:死亡受体、线粒体、内质网通路 Csapase、P53、Bcl-2 介导的信号通路
自噬:PI3K-AKT-mTOR,MAPK-ERK1/2-mTOR 信号通路
坏死:TNFα、TNFR1、TLR3、trail、FasL、ROS、PKC-MAPK-AP-1 介导的信号通路
焦亡:Caspase-1,NLRP3 介导的信号通路
5、释放损伤相关分子
铁死亡:HMGB1
凋亡:Ecto-CRT, HMGB1,and ATP
自噬:HMGB-1
坏死:DNA and IL-6
焦亡:HMGB1, ATP, IL-1β, and IL-18
6、免疫特征
铁死亡:促炎
凋亡:主要是抗炎
自噬:主要是抗炎
坏死:多数促炎
焦亡:促炎
7、诱导剂
铁死亡:Erastin, DPI2, BSO, SAS,lanperisone, SRS, RSL3, DPI7, DPI10, FIN56, sorafenib, artemisinin
凋亡:FASL, DCC, UNC5B
自噬:Rapamycin, lithium, sodium, valproate, carbamazepine, C2-ceramide
坏死:TNFa, zVAD-fmk, PAMPS
焦亡:ZnO—NPs, Ivermectin
8、抑制剂
铁死亡:Desferoxamine, vitamin E,U0126, ferrostatin-1, SRS, CA-1, cycloheximide, aminooxyacetic acid Liproxstatin-1 HCl
凋亡:XIAP, c-IAP1, c-IAP2, ILP-2, ML-IAP/livin, NAIP, Z-VADFMK
自噬:3-MA, LY294002, wortmannin, PIK-III, compound 31, SAR 405, Vps34- In1, MRT68921,Spautin-1, Bafilomycin A1, hydrochloroquin
坏死:Nec-1, NSA, Kongensin-A
焦亡:Necrosulfonami-de
9、检测方法
铁死亡:形态学检测(电镜检测)、 细胞内活性氧和脂质活性氧检测(通过流式细胞术使用H2DCFDA、C11-BODIPY 和Liperfluo检测)、铁离子水平检测(比色法和荧光法)、细胞活性检测(MTT/CCK8、Tunel、流式)、线粒体膜电位检测(最常用的探针是JC-1和JC-10)、分子水平检测(WB、QPCR等检测相关因子变化,如system xc(SLC7A11和SLC3A2),GPX4等)。
凋亡:形态学检测(电镜检测)、细胞膜表面磷酯酰丝氨酸检测(流式检测)、细胞核染色、线粒体膜电位检测、分子水平检测(WB、IHC、IF、QPCR等检测相关因子变化,如caspase3\BCL2\BAX等)、DNA片段化检测(核酸电泳)、DNA片段原位检测(Tunel)。
自噬:形态学检测(电镜检测)、双荧光穿梭质粒系统检测、单荧光质粒系统检测(GFP-LC3指示技术)、分子水平检测(WB、IHC、IF等检测相关因子变化,如LC3. ATG family, p62(SQSTM1), Beclin 1, ULK1等)
坏死:形态学观察(电镜检测)、免疫荧光或流式方法(PI或7-AAD染色,因为PI、7-AAD可以与DNA结合,如果细胞膜破裂,染料就可以进入细胞内,从而发荧光。)
焦亡:形态学检测(电镜检测);细胞活性检测(MTT/CCK8、Tunel、流式);分子水平检测(WB、IHC、IF、QPCR等检测相关因子变化,如NLRP3、ASC、Pro-caspase-1、Cleaved-caspase-1、Pro-IL-1β、Cleaved-IL-1β、Pro-IL-18等)、ELISA。
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