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生信笔记1-如何对SNP进行Hardy-Weinberg检验

作者：猪猪小牛爱生信发布时间：2024-09-09

这个分析主要针对那种列名为各个SNP的名称，行名为各个样本的基因型的数据集开展Hardy-Weinberg检验。 也就是大概长成下面这个样子的数据（只是一个示意图）： [图片] 主要是利用卡方检验来对该数据是否符合Hardy-Weinberg平衡，也就是我们的数据集本身是一个Case的组（在代码里我们称其成为x组），而我们要去构造一个符合Hardy-Weinberg平衡的Control组（在代码里我们称其为y组），使用卡方检验探究两组数据之间是否存在差异（p>0.05就可以简单粗暴地说两组没有显著差异，也...【查看原文】

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海鲸AI 2024-01-09

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